O Aquário assume com muito entusiasmo a importante missão de contribuir para a conservação dos rios, através do projeto “Conservação ex situ de organismos fluviais”, no âmbito do qual se têm reproduzido peixes dos nossos rios, seriamente ameaçados. Desde o início do projeto foram já libertados na natureza milhares de peixes.
Com a colaboração de uma estagiária de mestrado e o apoio do ISPA que nos ofereceu uma máquina de fotografia ao microscópio, foi realizado um trabalho de descrição dos ovos e larvas do ruivaco-do-oeste - Achondrostoma occidentale. O resultado deste trabalho foi divulgado no congresso 2020 da Sociedade Ibérica de Ictiologia, tendo sido produzido um poster apresentado num dos painéis de divulgação do congresso.