Em 1898, na altura da inauguração do Aquário Vasco da Gama, o Rei D. Carlos I realizou numa das salas uma exposição temporária com os espécimes zoológicos por ele recolhidos nas primeiras campanhas oceanográficas realizadas em 1896 e 1897.
Curiosamente esses mesmos espécimes regressaram anos mais tarde, em 1935, ao Aquário Vasco da Gama, integrando a Coleção do Museu Oceanográfico do Rei D. Carlos I, enriquecendo de tal forma o seu espólio, que ainda hoje este é essencialmente conhecido pelos exemplares raros associados ao monarca oceanógrafo.
Com o passar dos anos o museu do Aquário Vasco da Gama foi reunindo espécimes zoológicos com interesse, muitos provenientes de ofertas de pescadores empenhados em contribuir para a divulgação da diversidade de seres aquáticos que habita o nosso território marinho: moluscos, peixes marinhos, peixes de água doce, aves aquáticas, tartarugas e mamíferos marinhos fazem parte de um acervo valioso.